Annika Körner studierte European Economics Studies im Bachelor an der Otto-Friedrich-Universität Bamberg und der University of Lativa. An der Universität Duisburg-Essen schloss Sie einen Bachelor der Politikwissenschaft an. Im Anschluss absolvierte sie den Masterstudiengang „Politikmanagement, Public Policy und öffentliche Verwaltung” an der NRW School of Governance. In ihrer Masterarbeit widmete sie sich der Frage der „NGO-isierung von Public Interest Verbänden”.
Seit Januar 2022 ist Annika Körner Wissenschaftliche Mitarbeiterin an der Professur für Public Policy und Landespolitik.